La agroindustria del café representa una de las principales actividades económicas en comunidades rurales de países en desarrollo; sin embargo, su procesamiento genera aguas residuales con alta carga orgánica y compuestos emergentes como la cafeína. En ausencia de infraestructura de saneamiento, estas descargas suelen mezclarse con las aguas residuales municipales, incrementando el riesgo de contaminación de cuerpos de agua y comprometiendo la salud ambiental y social de las comunidades. Frente a este panorama, es fundamental explorar alternativas sostenibles y de bajo costo como los humedales construidos ornamentales. El presente estudio evaluó el desempeño de un sistema híbrido a escala real conformado por un tanque sedimentador y celdas de humedales (HC-FS y HC-FSS) sembradas con especies ornamentales (Eichhornia crassipes, Alocasia odora, Hedychium coronarium, Heliconia psittacorum y Zantedeschia aethiopica). El monitoreo de febrero a julio de 2024 incluyó la determinación de cafeína mediante espectrofotometría UV-Visible en temporada de cosecha y procesamiento de café y en temporada donde solo se registraron aguas residuales rurales.  El sistema alcanzó una eficiencia promedio de eliminación superior al 99 % en la temporada de cosecha y procesamiento de café. Las especies ornamentales se adaptaron favorablemente, demostrando potencial ornamental y comercial. Este trabajo aporta evidencia a escala real del potencial de los humedales construidos ornamentales como una solución práctica y replicable para tratar aguas residuales rurales mezcladas con efluentes del café, al tiempo que promueven beneficios ambientales, sociales y económicos para las comunidades rurales.