La industria citrícola produce una cantidad considerable de residuos sólidos y líquidos, que en su mayoría se desperdician. La digestión anaerobia de los lodos de depuradora es una opción atractiva, ya que puede producir combustibles en forma de gas metano. Sin embargo, la presencia de compuestos orgánicos complejos y de microorganismos patógenos dificulta considerablemente la eficacia de este proceso. El objetivo de este trabajo es la selección de una fuente de inóculo libre de microorganismos patógenos mediante un pretratamiento térmico y de esta forma sea propicio para el tratamiento de lodos residuales de la industria Citrícola. El inóculo se tomó de un reactor de geomembrana que utiliza estiércol bovino como sustrato. Se realizaron 6 cinéticas de biodegradabilidad, variando la relación sustrato-inóculo, tres de ellas con inóculo sin pretratamiento y otras tres con tratamiento, todas ellas en condiciones mesófilas. Se determinaron los parámetros SV, pH y producción de biogás.