Evaluación del efecto de la salinidad en el procesamiento del tRNACys durante la germinación de esporas de Bacillus subtilis usando RNA-seq

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Autores/as

  • Iván Arvizu-Hernández Laboratorio de Bacteriología molecular, Facultad de Química, Universidad Autónoma de Querétaro, Cerro de las Campanas S/N, 76010 Querétaro, Qro., México
  • Juan Caballero-Pérez Databiology Ltd, Oxford, OX4 4GA, United Kingdom
  • George H. Jones Department of Biology, Emory University, Atlanta, Georgia, USA.
  • Juan Campos-Guillén Laboratorio de Bacteriología molecular, Facultad de Química, Universidad Autónoma de Querétaro, Cerro de las Campanas S/N, 76010 Querétaro, Qro., México

DOI:

https://doi.org/10.56845/rebs.v2i1.13

Palabras clave:

estrés osmótico, secuenciación de RNA, esporulación

Resumen

En su hábitat natural, la bacteria del suelo Bacillus subtilis, está expuesta a condiciones ambientales fluctuantes, principalmente a estrés osmótico y estrés por deficiencia de nutrientes (Marles-Wright y Lewis, 2007; Schultz et al., 2007). Al agotarse los nutrientes, esta bacteria genera esporas que germinan para formar células vegetativas cuando los nutrientes vuelven a estar disponibles en el medio (Bremer, 2002). En este sentido, los mecanismos moleculares de acumulación tRNAs durante la esporulación son una prioridad, ya que desempeñan un papel esencial en la traducción durante la germinación de esporas y su fase de crecimiento posterior (Keijser et al., 2007). Los efectos del estrés salino en la expresión génica se han analizado previamente durante la germinación y el crecimiento. Sin embargo, no se ha estudiado ampliamente el procesamiento de los tRNAs en estas condiciones. En este estudio investigamos el perfil de tRNACys en esporas de B. subtilisy en crecimiento en ausencia/presencia de 1. 2M de NaCl.

Citas

Bremer, E. (2002). “Adaptation to changing osmolarity,” in Bacillus subtilis and its Closest Relatives: From Genes to Cells, eds A. L. Sonnenshein, R. M. Losick, and J. A. Hoch (Washington, DC: ASM Press), 385–391. DOI: https://doi.org/10.1128/9781555817992.ch27

Keijser, B. J., Ter Beek, A., Rauwerda, H., Schuren, F., Montijn, R., van der Spek, H., & Brul, S. (2007). Analysis of temporal gene expression during Bacillus subtilis spore germination and outgrowth. Journal of bacteriology, 189(9), 3624-3634. DOI: https://doi.org/10.1128/JB.01736-06

Marles-Wright, J., & Lewis, R. J. (2007). Stress responses of bacteria. Current opinion in structural biology, 17(6), 755-760. DOI: https://doi.org/10.1016/j.sbi.2007.08.004

Nagler, K., Krawczyk, A. O., De Jong, A., Madela, K., Hoffmann, T., Laue, M., Kuipers, O. P., Bremer, E., & Moeller, R. (2016). Identification of Differentially Expressed Genes during Bacillus subtilis Spore Outgrowth in High-Salinity Environments Using RNA Sequencing. Frontiers in microbiology, 7, 1564. DOI: https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.01564

Schultz, D., Wolynes, P. G., Jacob, E. B., & Onuchic, J. N. (2009). Deciding fate in adverse times: sporulation and competence in Bacillus subtilis. Proceedings of the National Academy of Sciences, 106(50), 21027-21034. DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.0912185106

REB&S Vol. 2, No. 1 Cover

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Publicado

2020-06-08

Cómo citar

Arvizu-Hernández, I., Caballero-Pérez, J., Jones, G. H., & Campos-Guillén, J. (2020). Evaluación del efecto de la salinidad en el procesamiento del tRNACys durante la germinación de esporas de Bacillus subtilis usando RNA-seq. Renewable Energy, Biomass & Sustainability, 2(1), 1. https://doi.org/10.56845/rebs.v2i1.13

Número

Vol. 2 Núm. 1 (2020)

Sección

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