e-ISSN: 2683-2658
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Renewable Energy, Biomass & Sustainability

Acceso abierto

Evaluación del efecto de la salinidad en el procesamiento del tRNACys durante la germinación de esporas de Bacillus subtilis usando RNA-seq

DOI 10.56845/rebs.v2i1.13
PDF (English)
Iván Arvizu-Hernández1 , Juan Caballero-Pérez2 , George H. Jones3 , Juan Campos-Guillén1
1 Laboratorio de Bacteriología molecular, Facultad de Química, Universidad Autónoma de Querétaro, Cerro de las Campanas S/N, 76010 Querétaro, Qro., México
2 Databiology Ltd, Oxford, OX4 4GA, United Kingdom
3 Department of Biology, Emory University, Atlanta, Georgia, USA.

Abstract

En su hábitat natural, la bacteria del suelo Bacillus subtilis, está expuesta a condiciones ambientales fluctuantes, principalmente a estrés osmótico y estrés por deficiencia de nutrientes (Marles-Wright y Lewis, 2007; Schultz et al., 2007). Al agotarse los nutrientes, esta bacteria genera esporas que germinan para formar células vegetativas cuando los nutrientes vuelven a estar disponibles en el medio (Bremer, 2002). En este sentido, los mecanismos moleculares de acumulación tRNAs durante la esporulación son una prioridad, ya que desempeñan un papel esencial en la traducción durante la germinación de esporas y su fase de crecimiento posterior (Keijser et al., 2007). Los efectos del estrés salino en la expresión génica se han analizado previamente durante la germinación y el crecimiento. Sin embargo, no se ha estudiado ampliamente el procesamiento de los tRNAs en estas condiciones. En este estudio investigamos el perfil de tRNACys en esporas de B. subtilisy en crecimiento en ausencia/presencia de 1. 2M de NaCl.

Keywords

estrés osmótico,secuenciación de RNA,esporulación

How to Cite

Arvizu-Hernández, I., Caballero-Pérez, J., Jones, G. H., & Campos-Guillén, J. (2020). Evaluación del efecto de la salinidad en el procesamiento del tRNACys durante la germinación de esporas de Bacillus subtilis usando RNA-seq. Renewable Energy, Biomass & Sustainability, 2(1), 1. https://doi.org/10.56845/rebs.v2i1.13
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References

📄 Bremer, E. (2002). “Adaptation to changing osmolarity,” in Bacillus subtilis and its Closest Relatives: From Genes to Cells, eds A. L. Sonnenshein, R. M. Losick, and J. A. Hoch (Washington, DC: ASM Press), 385–391.
📄 Keijser, B. J., Ter Beek, A., Rauwerda, H., Schuren, F., Montijn, R., van der Spek, H., & Brul, S. (2007). Analysis of temporal gene expression during Bacillus subtilis spore germination and outgrowth. Journal of bacteriology, 189(9), 3624-3634.
📄 Marles-Wright, J., & Lewis, R. J. (2007). Stress responses of bacteria. Current opinion in structural biology, 17(6), 755-760.
📄 Nagler, K., Krawczyk, A. O., De Jong, A., Madela, K., Hoffmann, T., Laue, M., Kuipers, O. P., Bremer, E., & Moeller, R. (2016). Identification of Differentially Expressed Genes during Bacillus subtilis Spore Outgrowth in High-Salinity Environments Using RNA Sequencing. Frontiers in microbiology, 7, 1564.
📄 Schultz, D., Wolynes, P. G., Jacob, E. B., & Onuchic, J. N. (2009). Deciding fate in adverse times: sporulation and competence in Bacillus subtilis. Proceedings of the National Academy of Sciences, 106(50), 21027-21034.